454 Life Sciences, eine Tochterfirma von Roche, gab heute die Markteinführung der neuen Paired-End-Adapter der GS FLX Titanium Series Library bekannt, mit denen Verbesserungen bei der De-novo-Sequenzierung vollständiger Genome und eine Assemblierung von hoher Qualität mit dem Genome Sequencer FLX System erreicht werden. Das Genome Sequencer FLX System ist aufgrund der in Shotgunverfahren möglichen langen Reads von 400-500 Basenpaaren weithin als am besten geeignete Plattform für De-novo-Sequenzierungen anerkannt. Durch die jetzt erhältlichen 3 kb, 8 kb oder 20 kb umspannenden Paired-End-Bibliotheken und die verbesserte Assembly-Software können immer komplexere Genome jetzt noch schneller assembliert werden.
De-novo-Sequenzierungen, also Genomsequenzierungen ohne Verwendung einer Referenzsequenz, wurden durch die Technologie des 454 Sequenziersystems in den letzten Jahren erheblich erleichtert. Die neuen Paired-End-Produkte der GS FLX Titanium Serie gehen einen weiteren Schritt in diese Richtung: sie bieten Biologen eine vollständigere Abdeckung des Genoms, ermöglichen die Assemblierung in weniger, größere Scaffolds sowie die Erforschung der gesamten Bandbreite der genetischen Variabilität. Dank optimierter Prozesse können Forscher jetzt mehrere Shotgun- und Paired-End-Bibliotheken gleichzeitig in einem 10-stündigen Lauf sequenzieren und erhalten so schnellere Ergebnisse. Mit den einmaligen, besonders langen, 20 kb umspannenden Reads können jetzt auch die hochrepetitiven Abschnitte komplexer Genome abgedeckt werden, so dass, in Kombination mit langen Shotgun-Reads, die Notwendigkeit zum zeitaufwendigen Einsatz von Fosmiden und der Sanger-Methode praktisch entfällt. Außerdem werden Schnelligkeit und Leistungsfähigkeit bei der Verarbeitung großer, komplexerer Genome durch verbesserte Algorithmen des Programms GS Assembler erhöht.
"Die neuen Paired-End-Sequenzierungsprodukte der GS-FLX-Titanium-Serie eröffnen neue Möglichkeiten in einigen wichtigen Forschungsfeldern.", erklärte Chris McLeod, Präsident und Geschäftsführer von 454 Life Sciences. "In der Mikrobiologie können jetzt fast fertige Assemblys mehrerer Genome in einer Woche aus den Daten eines einzigen Sequenzierlaufs erstellt werden. Forscher, die größere Genome, wie zum Beispiel Pflanzengenome oder Genome gefährdeter Arten, untersuchen, profitieren von den deutlichen Verbesserungen der Technik und Software, die die Sequenzierung und Assemblierung komplexer Genome vereinfachen. Mit diesen neuen Produkten kommen wir unserem Ziel, Wissenschaftlern vollständige Lösungen für den Weg von der DNA zu biologisch aussagekräftigen Ergebnissen zur Verfügung zu stellen, ein weiteres Stück näher."
Weitere Informationen zur Paired-End-Sequenzierung, detaillierte Daten zur Assemblierung sowie eine vollständige Liste der Peer-Review-Publikationen finden Sie auf www.454.com.
De-novo-Sequenzierungen, also Genomsequenzierungen ohne Verwendung einer Referenzsequenz, wurden durch die Technologie des 454 Sequenziersystems in den letzten Jahren erheblich erleichtert. Die neuen Paired-End-Produkte der GS FLX Titanium Serie gehen einen weiteren Schritt in diese Richtung: sie bieten Biologen eine vollständigere Abdeckung des Genoms, ermöglichen die Assemblierung in weniger, größere Scaffolds sowie die Erforschung der gesamten Bandbreite der genetischen Variabilität. Dank optimierter Prozesse können Forscher jetzt mehrere Shotgun- und Paired-End-Bibliotheken gleichzeitig in einem 10-stündigen Lauf sequenzieren und erhalten so schnellere Ergebnisse. Mit den einmaligen, besonders langen, 20 kb umspannenden Reads können jetzt auch die hochrepetitiven Abschnitte komplexer Genome abgedeckt werden, so dass, in Kombination mit langen Shotgun-Reads, die Notwendigkeit zum zeitaufwendigen Einsatz von Fosmiden und der Sanger-Methode praktisch entfällt. Außerdem werden Schnelligkeit und Leistungsfähigkeit bei der Verarbeitung großer, komplexerer Genome durch verbesserte Algorithmen des Programms GS Assembler erhöht.
"Die neuen Paired-End-Sequenzierungsprodukte der GS-FLX-Titanium-Serie eröffnen neue Möglichkeiten in einigen wichtigen Forschungsfeldern.", erklärte Chris McLeod, Präsident und Geschäftsführer von 454 Life Sciences. "In der Mikrobiologie können jetzt fast fertige Assemblys mehrerer Genome in einer Woche aus den Daten eines einzigen Sequenzierlaufs erstellt werden. Forscher, die größere Genome, wie zum Beispiel Pflanzengenome oder Genome gefährdeter Arten, untersuchen, profitieren von den deutlichen Verbesserungen der Technik und Software, die die Sequenzierung und Assemblierung komplexer Genome vereinfachen. Mit diesen neuen Produkten kommen wir unserem Ziel, Wissenschaftlern vollständige Lösungen für den Weg von der DNA zu biologisch aussagekräftigen Ergebnissen zur Verfügung zu stellen, ein weiteres Stück näher."
Weitere Informationen zur Paired-End-Sequenzierung, detaillierte Daten zur Assemblierung sowie eine vollständige Liste der Peer-Review-Publikationen finden Sie auf www.454.com.
